Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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F8a1Q00558 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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F8a1Q00558 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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F8a1Q00558 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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F8a1Q00558 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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F8a1Q00558 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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