Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb4P99026 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb4P99026 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb4P99026 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb4P99026 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb4P99026 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb4P99026 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb4P99026 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb4P99026 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb4P99026 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb4P99026 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb4P99026 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb4P99026 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb4P99026 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb4P99026 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb4P99026 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb4P99026 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb4P99026 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb4P99026 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb4P99026 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb4P99026 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb4P99026 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb4P99026 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb4P99026 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb4P99026 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb4P99026 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb4P99026 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb4P99026 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb4P99026 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb4P99026 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb4P99026 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb4P99026 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Psmb4P99026 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Psmb4P99026 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Psmb4P99026 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Psmb4P99026 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Psmb4P99026 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Psmb4P99026 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Psmb4P99026 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Psmb4P99026 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Psmb4P99026 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Psmb4P99026 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Psmb4P99026 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Psmb4P99026 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Psmb4P99026 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Psmb4P99026 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Psmb4P99026 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Psmb4P99026 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Psmb4P99026 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Psmb4P99026 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Psmb4P99026 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Psmb4P99026 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Psmb4P99026 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Psmb4P99026 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Psmb4P99026 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Psmb4P99026 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Psmb4P99026 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Psmb4P99026 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Psmb4P99026 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Psmb4P99026 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Psmb4P99026 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Psmb4P99026 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Psmb4P99026 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Psmb4P99026 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Psmb4P99026 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Psmb4P99026 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Psmb4P99026 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Psmb4P99026 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Psmb4P99026 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Psmb4P99026 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Psmb4P99026 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Psmb4P99026 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Psmb4P99026 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Psmb4P99026 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Psmb4P99026 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Psmb4P99026 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Psmb4P99026 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Psmb4P99026 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psmb4P99026 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psmb4P99026 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psmb4P99026 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psmb4P99026 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psmb4P99026 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psmb4P99026 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psmb4P99026 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psmb4P99026 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psmb4P99026 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psmb4P99026 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psmb4P99026 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Psmb4P99026 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psmb4P99026 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psmb4P99026 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psmb4P99026 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psmb4P99026 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psmb4P99026 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psmb4P99026 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psmb4P99026 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psmb4P99026 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psmb4P99026 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psmb4P99026 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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