Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Bop1P97452 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bop1P97452 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bop1P97452 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Bop1P97452 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Bop1P97452 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bop1P97452 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bop1P97452 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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