Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Taf1bP97358 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Taf1bP97358 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Taf1bP97358 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Taf1bP97358 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Taf1bP97358 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Taf1bP97358 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Taf1bP97358 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Taf1bP97358 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf1bP97358 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf1bP97358 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf1bP97358 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf1bP97358 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf1bP97358 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf1bP97358 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf1bP97358 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf1bP97358 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf1bP97358 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf1bP97358 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf1bP97358 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf1bP97358 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf1bP97358 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Taf1bP97358 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Taf1bP97358 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Taf1bP97358 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf1bP97358 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf1bP97358 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf1bP97358 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf1bP97358 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf1bP97358 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Taf1bP97358 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Taf1bP97358 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Taf1bP97358 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Taf1bP97358 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Taf1bP97358 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Taf1bP97358 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Taf1bP97358 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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