Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cbx1P83917 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cbx1P83917 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cbx1P83917 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cbx1P83917 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cbx1P83917 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cbx1P83917 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cbx1P83917 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Cbx1P83917 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cbx1P83917 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cbx1P83917 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cbx1P83917 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cbx1P83917 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cbx1P83917 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cbx1P83917 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cbx1P83917 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cbx1P83917 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cbx1P83917 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cbx1P83917 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Cbx1P83917 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cbx1P83917 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cbx1P83917 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cbx1P83917 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cbx1P83917 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cbx1P83917 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cbx1P83917 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cbx1P83917 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cbx1P83917 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cbx1P83917 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cbx1P83917 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Cbx1P83917 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cbx1P83917 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Cbx1P83917 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cbx1P83917 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cbx1P83917 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cbx1P83917 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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