Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tubg1P83887 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tubg1P83887 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tubg1P83887 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tubg1P83887 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tubg1P83887 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tubg1P83887 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tubg1P83887 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tubg1P83887 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tubg1P83887 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tubg1P83887 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tubg1P83887 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tubg1P83887 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tubg1P83887 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tubg1P83887 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tubg1P83887 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tubg1P83887 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tubg1P83887 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tubg1P83887 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tubg1P83887 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tubg1P83887 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tubg1P83887 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tubg1P83887 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tubg1P83887 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tubg1P83887 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tubg1P83887 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tubg1P83887 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tubg1P83887 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tubg1P83887 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tubg1P83887 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Tubg1P83887 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tubg1P83887 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tubg1P83887 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tubg1P83887 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tubg1P83887 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tubg1P83887 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tubg1P83887 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tubg1P83887 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tubg1P83887 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tubg1P83887 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tubg1P83887 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tubg1P83887 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tubg1P83887 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tubg1P83887 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tubg1P83887 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tubg1P83887 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tubg1P83887 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tubg1P83887 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tubg1P83887 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tubg1P83887 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tubg1P83887 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tubg1P83887 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tubg1P83887 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tubg1P83887 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.7 ms