Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irx1P81068 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irx1P81068 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irx1P81068 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irx1P81068 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irx1P81068 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irx1P81068 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Irx1P81068 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Irx1P81068 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irx1P81068 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irx1P81068 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irx1P81068 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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