Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms