Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chl1P70232 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Chl1P70232 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chl1P70232 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chl1P70232 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chl1P70232 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chl1P70232 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chl1P70232 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chl1P70232 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chl1P70232 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chl1P70232 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chl1P70232 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chl1P70232 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms