Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms