Protein–RNA interactions for Protein: P62821

Rab1A, Ras-related protein Rab-1A, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1AP62821 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab1AP62821 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab1AP62821 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab1AP62821 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab1AP62821 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab1AP62821 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab1AP62821 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab1AP62821 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab1AP62821 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab1AP62821 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab1AP62821 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab1AP62821 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab1AP62821 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab1AP62821 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab1AP62821 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab1AP62821 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab1AP62821 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab1AP62821 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab1AP62821 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab1AP62821 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab1AP62821 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab1AP62821 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab1AP62821 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab1AP62821 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab1AP62821 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab1AP62821 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab1AP62821 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab1AP62821 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab1AP62821 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab1AP62821 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab1AP62821 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab1AP62821 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab1AP62821 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab1AP62821 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab1AP62821 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab1AP62821 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab1AP62821 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab1AP62821 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab1AP62821 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab1AP62821 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab1AP62821 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab1AP62821 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab1AP62821 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab1AP62821 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab1AP62821 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab1AP62821 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab1AP62821 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab1AP62821 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab1AP62821 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab1AP62821 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab1AP62821 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab1AP62821 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab1AP62821 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab1AP62821 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab1AP62821 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab1AP62821 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab1AP62821 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab1AP62821 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab1AP62821 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab1AP62821 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab1AP62821 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab1AP62821 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab1AP62821 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab1AP62821 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab1AP62821 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
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Rab1AP62821 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab1AP62821 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab1AP62821 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab1AP62821 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rab1AP62821 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rab1AP62821 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rab1AP62821 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rab1AP62821 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rab1AP62821 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab1AP62821 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab1AP62821 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab1AP62821 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab1AP62821 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab1AP62821 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab1AP62821 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab1AP62821 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab1AP62821 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab1AP62821 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab1AP62821 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab1AP62821 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab1AP62821 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab1AP62821 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab1AP62821 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab1AP62821 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab1AP62821 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab1AP62821 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab1AP62821 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab1AP62821 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab1AP62821 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab1AP62821 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab1AP62821 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab1AP62821 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab1AP62821 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab1AP62821 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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