Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms