Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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