Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itga11P61622 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itga11P61622 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Itga11P61622 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga11P61622 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itga11P61622 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms