Protein–RNA interactions for Protein: P59328

Wdhd1, WD repeat and HMG-box DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdhd1P59328 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Wdhd1P59328 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdhd1P59328 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdhd1P59328 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdhd1P59328 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdhd1P59328 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdhd1P59328 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms