Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcstnP57716 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcstnP57716 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NcstnP57716 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcstnP57716 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcstnP57716 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcstnP57716 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcstnP57716 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcstnP57716 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcstnP57716 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcstnP57716 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcstnP57716 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcstnP57716 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcstnP57716 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcstnP57716 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NcstnP57716 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcstnP57716 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcstnP57716 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NcstnP57716 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcstnP57716 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcstnP57716 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcstnP57716 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcstnP57716 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcstnP57716 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcstnP57716 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcstnP57716 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcstnP57716 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcstnP57716 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcstnP57716 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcstnP57716 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcstnP57716 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcstnP57716 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcstnP57716 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcstnP57716 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
NcstnP57716 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcstnP57716 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcstnP57716 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcstnP57716 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcstnP57716 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcstnP57716 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcstnP57716 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcstnP57716 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcstnP57716 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcstnP57716 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcstnP57716 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcstnP57716 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcstnP57716 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcstnP57716 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcstnP57716 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcstnP57716 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcstnP57716 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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NcstnP57716 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcstnP57716 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcstnP57716 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcstnP57716 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcstnP57716 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NcstnP57716 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NcstnP57716 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcstnP57716 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcstnP57716 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcstnP57716 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcstnP57716 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcstnP57716 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcstnP57716 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcstnP57716 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcstnP57716 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcstnP57716 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcstnP57716 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcstnP57716 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcstnP57716 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcstnP57716 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcstnP57716 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcstnP57716 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcstnP57716 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcstnP57716 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcstnP57716 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcstnP57716 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcstnP57716 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcstnP57716 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcstnP57716 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcstnP57716 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcstnP57716 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcstnP57716 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcstnP57716 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcstnP57716 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NcstnP57716 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NcstnP57716 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NcstnP57716 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NcstnP57716 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NcstnP57716 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NcstnP57716 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NcstnP57716 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NcstnP57716 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NcstnP57716 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NcstnP57716 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NcstnP57716 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NcstnP57716 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NcstnP57716 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NcstnP57716 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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