Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp25P57080 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp25P57080 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp25P57080 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp25P57080 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp25P57080 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp25P57080 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp25P57080 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp25P57080 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp25P57080 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms