Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Gsc2P56916 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Gsc2P56916 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
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Gsc2P56916 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Gsc2P56916 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
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Gsc2P56916 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Gsc2P56916 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Gsc2P56916 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Gsc2P56916 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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