Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp5P56399 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp5P56399 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp5P56399 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp5P56399 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp5P56399 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp5P56399 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp5P56399 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp5P56399 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp5P56399 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms