Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms