Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Efnb1P52795 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Efnb1P52795 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Efnb1P52795 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Efnb1P52795 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Efnb1P52795 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Efnb1P52795 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Efnb1P52795 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms