Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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