Protein–RNA interactions for Protein: P50752

Tnnt2, Troponin T, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt2P50752 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnt2P50752 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms