Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LtbrP50284 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtbrP50284 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtbrP50284 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LtbrP50284 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms