Protein–RNA interactions for Protein: P49766

Vegfb, Vascular endothelial growth factor B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfbP49766 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfbP49766 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfbP49766 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfbP49766 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfbP49766 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfbP49766 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfbP49766 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfbP49766 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfbP49766 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms