Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt1P46096 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt1P46096 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt1P46096 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt1P46096 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Syt1P46096 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syt1P46096 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syt1P46096 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syt1P46096 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt1P46096 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt1P46096 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt1P46096 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt1P46096 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt1P46096 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt1P46096 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt1P46096 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt1P46096 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt1P46096 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt1P46096 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt1P46096 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt1P46096 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt1P46096 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt1P46096 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt1P46096 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt1P46096 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt1P46096 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt1P46096 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt1P46096 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt1P46096 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt1P46096 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt1P46096 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt1P46096 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt1P46096 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt1P46096 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt1P46096 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt1P46096 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt1P46096 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt1P46096 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt1P46096 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt1P46096 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt1P46096 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt1P46096 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt1P46096 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syt1P46096 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syt1P46096 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syt1P46096 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syt1P46096 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syt1P46096 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syt1P46096 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syt1P46096 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syt1P46096 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syt1P46096 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syt1P46096 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syt1P46096 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syt1P46096 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syt1P46096 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syt1P46096 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syt1P46096 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syt1P46096 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syt1P46096 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syt1P46096 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms