Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VhlP40338 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VhlP40338 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VhlP40338 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VhlP40338 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VhlP40338 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VhlP40338 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
VhlP40338 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VhlP40338 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VhlP40338 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VhlP40338 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VhlP40338 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VhlP40338 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VhlP40338 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
VhlP40338 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
VhlP40338 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
VhlP40338 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
VhlP40338 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VhlP40338 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VhlP40338 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
VhlP40338 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
VhlP40338 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
VhlP40338 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
VhlP40338 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VhlP40338 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
VhlP40338 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
VhlP40338 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VhlP40338 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
VhlP40338 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VhlP40338 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
VhlP40338 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
VhlP40338 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
VhlP40338 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VhlP40338 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VhlP40338 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VhlP40338 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
VhlP40338 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
VhlP40338 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
VhlP40338 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VhlP40338 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VhlP40338 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VhlP40338 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
VhlP40338 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VhlP40338 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VhlP40338 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VhlP40338 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
VhlP40338 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VhlP40338 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VhlP40338 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VhlP40338 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VhlP40338 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VhlP40338 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VhlP40338 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VhlP40338 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VhlP40338 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VhlP40338 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VhlP40338 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VhlP40338 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VhlP40338 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VhlP40338 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VhlP40338 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VhlP40338 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VhlP40338 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VhlP40338 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VhlP40338 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VhlP40338 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VhlP40338 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VhlP40338 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VhlP40338 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
VhlP40338 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VhlP40338 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
VhlP40338 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VhlP40338 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VhlP40338 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VhlP40338 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VhlP40338 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VhlP40338 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VhlP40338 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VhlP40338 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VhlP40338 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VhlP40338 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
VhlP40338 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VhlP40338 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VhlP40338 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VhlP40338 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
VhlP40338 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VhlP40338 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VhlP40338 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VhlP40338 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VhlP40338 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VhlP40338 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VhlP40338 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VhlP40338 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
VhlP40338 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VhlP40338 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VhlP40338 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VhlP40338 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VhlP40338 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VhlP40338 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VhlP40338 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms