Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

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Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PtprkP35822 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprkP35822 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprkP35822 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprkP35822 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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PtprkP35822 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
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PtprkP35822 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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PtprkP35822 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprkP35822 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprkP35822 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprkP35822 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprkP35822 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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