Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp4P35123 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp4P35123 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp4P35123 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp4P35123 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Usp4P35123 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp4P35123 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Usp4P35123 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Usp4P35123 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Usp4P35123 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp4P35123 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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