Protein–RNA interactions for Protein: P33435

Mmp13, Collagenase 3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp13P33435 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mmp13P33435 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mmp13P33435 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mmp13P33435 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mmp13P33435 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mmp13P33435 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mmp13P33435 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mmp13P33435 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Mmp13P33435 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mmp13P33435 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mmp13P33435 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mmp13P33435 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mmp13P33435 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mmp13P33435 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mmp13P33435 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mmp13P33435 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Mmp13P33435 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mmp13P33435 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mmp13P33435 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mmp13P33435 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mmp13P33435 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mmp13P33435 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mmp13P33435 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mmp13P33435 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mmp13P33435 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mmp13P33435 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mmp13P33435 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mmp13P33435 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mmp13P33435 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Mmp13P33435 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mmp13P33435 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Mmp13P33435 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mmp13P33435 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Mmp13P33435 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mmp13P33435 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Mmp13P33435 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Mmp13P33435 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mmp13P33435 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mmp13P33435 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mmp13P33435 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Mmp13P33435 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mmp13P33435 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mmp13P33435 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mmp13P33435 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mmp13P33435 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mmp13P33435 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mmp13P33435 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Mmp13P33435 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mmp13P33435 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mmp13P33435 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Mmp13P33435 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
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Mmp13P33435 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mmp13P33435 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mmp13P33435 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mmp13P33435 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mmp13P33435 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mmp13P33435 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mmp13P33435 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mmp13P33435 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mmp13P33435 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mmp13P33435 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mmp13P33435 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mmp13P33435 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mmp13P33435 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mmp13P33435 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mmp13P33435 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mmp13P33435 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mmp13P33435 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mmp13P33435 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mmp13P33435 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mmp13P33435 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mmp13P33435 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mmp13P33435 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mmp13P33435 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mmp13P33435 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mmp13P33435 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mmp13P33435 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Mmp13P33435 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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