Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rom1P32958 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rom1P32958 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rom1P32958 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rom1P32958 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rom1P32958 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms