Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc10P31257 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc10P31257 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc10P31257 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc10P31257 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc10P31257 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc10P31257 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxc10P31257 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxc10P31257 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxc10P31257 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxc10P31257 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxc10P31257 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxc10P31257 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxc10P31257 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc10P31257 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms