Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VtnP29788 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VtnP29788 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC12□□□□□ -0.49
VtnP29788 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC12□□□□□ -0.49
VtnP29788 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VtnP29788 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VtnP29788 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VtnP29788 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
VtnP29788 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VtnP29788 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
VtnP29788 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VtnP29788 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12□□□□□ -0.49
VtnP29788 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VtnP29788 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VtnP29788 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VtnP29788 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
VtnP29788 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VtnP29788 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
VtnP29788 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
VtnP29788 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VtnP29788 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
VtnP29788 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VtnP29788 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VtnP29788 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
VtnP29788 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
VtnP29788 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VtnP29788 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VtnP29788 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VtnP29788 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VtnP29788 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VtnP29788 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VtnP29788 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VtnP29788 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VtnP29788 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VtnP29788 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VtnP29788 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VtnP29788 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VtnP29788 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VtnP29788 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VtnP29788 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
VtnP29788 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VtnP29788 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VtnP29788 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VtnP29788 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VtnP29788 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
VtnP29788 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VtnP29788 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VtnP29788 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VtnP29788 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
VtnP29788 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VtnP29788 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VtnP29788 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VtnP29788 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VtnP29788 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VtnP29788 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VtnP29788 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VtnP29788 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VtnP29788 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VtnP29788 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VtnP29788 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VtnP29788 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VtnP29788 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VtnP29788 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VtnP29788 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VtnP29788 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VtnP29788 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VtnP29788 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VtnP29788 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VtnP29788 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VtnP29788 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VtnP29788 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
VtnP29788 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VtnP29788 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VtnP29788 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VtnP29788 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VtnP29788 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VtnP29788 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
VtnP29788 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VtnP29788 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
VtnP29788 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VtnP29788 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
VtnP29788 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VtnP29788 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
VtnP29788 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VtnP29788 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VtnP29788 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VtnP29788 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VtnP29788 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
VtnP29788 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
VtnP29788 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
VtnP29788 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
VtnP29788 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VtnP29788 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VtnP29788 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
VtnP29788 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VtnP29788 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VtnP29788 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VtnP29788 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VtnP29788 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VtnP29788 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms