Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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