Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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