Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa2P28309 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa2P28309 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa2P28309 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa2P28309 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa2P28309 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa2P28309 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa2P28309 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms