Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RarbP22605 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RarbP22605 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RarbP22605 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RarbP22605 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RarbP22605 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RarbP22605 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RarbP22605 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RarbP22605 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RarbP22605 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RarbP22605 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RarbP22605 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RarbP22605 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RarbP22605 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RarbP22605 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RarbP22605 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RarbP22605 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RarbP22605 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RarbP22605 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RarbP22605 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RarbP22605 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RarbP22605 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RarbP22605 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RarbP22605 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RarbP22605 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RarbP22605 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RarbP22605 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RarbP22605 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RarbP22605 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RarbP22605 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RarbP22605 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RarbP22605 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RarbP22605 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RarbP22605 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RarbP22605 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RarbP22605 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RarbP22605 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RarbP22605 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RarbP22605 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RarbP22605 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RarbP22605 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RarbP22605 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RarbP22605 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RarbP22605 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RarbP22605 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RarbP22605 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RarbP22605 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RarbP22605 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RarbP22605 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RarbP22605 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RarbP22605 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RarbP22605 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RarbP22605 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RarbP22605 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RarbP22605 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RarbP22605 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RarbP22605 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RarbP22605 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RarbP22605 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RarbP22605 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RarbP22605 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RarbP22605 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RarbP22605 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RarbP22605 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RarbP22605 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RarbP22605 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RarbP22605 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RarbP22605 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RarbP22605 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RarbP22605 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RarbP22605 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RarbP22605 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RarbP22605 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RarbP22605 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RarbP22605 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RarbP22605 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RarbP22605 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RarbP22605 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RarbP22605 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RarbP22605 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RarbP22605 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RarbP22605 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RarbP22605 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RarbP22605 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RarbP22605 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RarbP22605 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RarbP22605 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RarbP22605 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RarbP22605 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RarbP22605 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RarbP22605 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RarbP22605 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RarbP22605 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RarbP22605 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RarbP22605 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RarbP22605 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RarbP22605 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RarbP22605 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RarbP22605 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RarbP22605 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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