Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
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PdgfaP20033 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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PdgfaP20033 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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PdgfaP20033 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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PdgfaP20033 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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PdgfaP20033 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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PdgfaP20033 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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PdgfaP20033 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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