Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Hoxb1P17919 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Hoxb1P17919 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Hoxb1P17919 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Hoxb1P17919 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Hoxb1P17919 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Hoxb1P17919 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Hoxb1P17919 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Hoxb1P17919 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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