Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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Defa-rs1P17533 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Defa-rs1P17533 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Defa-rs1P17533 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Defa-rs1P17533 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa-rs1P17533 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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