Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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