Protein–RNA interactions for Protein: P12246

Apcs, Serum amyloid P-component, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApcsP12246 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ApcsP12246 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ApcsP12246 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ApcsP12246 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ApcsP12246 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ApcsP12246 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
ApcsP12246 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
ApcsP12246 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
ApcsP12246 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
ApcsP12246 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
ApcsP12246 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
ApcsP12246 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
ApcsP12246 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
ApcsP12246 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ApcsP12246 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
ApcsP12246 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ApcsP12246 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ApcsP12246 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ApcsP12246 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ApcsP12246 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ApcsP12246 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ApcsP12246 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
ApcsP12246 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ApcsP12246 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ApcsP12246 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ApcsP12246 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ApcsP12246 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ApcsP12246 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ApcsP12246 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ApcsP12246 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms