Protein–RNA interactions for Protein: P11103

Parp1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp1P11103 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Parp1P11103 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Parp1P11103 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Parp1P11103 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Parp1P11103 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Parp1P11103 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp1P11103 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp1P11103 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp1P11103 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp1P11103 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp1P11103 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp1P11103 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp1P11103 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp1P11103 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp1P11103 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp1P11103 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp1P11103 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp1P11103 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp1P11103 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp1P11103 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp1P11103 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp1P11103 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp1P11103 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp1P11103 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp1P11103 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp1P11103 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp1P11103 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp1P11103 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp1P11103 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp1P11103 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp1P11103 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp1P11103 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp1P11103 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp1P11103 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp1P11103 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp1P11103 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp1P11103 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Parp1P11103 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Parp1P11103 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Parp1P11103 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Parp1P11103 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Parp1P11103 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Parp1P11103 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Parp1P11103 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Parp1P11103 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Parp1P11103 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Parp1P11103 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Parp1P11103 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Parp1P11103 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Parp1P11103 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Parp1P11103 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Parp1P11103 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Parp1P11103 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Parp1P11103 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Parp1P11103 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Parp1P11103 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Parp1P11103 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Parp1P11103 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Parp1P11103 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Parp1P11103 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Parp1P11103 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Parp1P11103 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Parp1P11103 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Parp1P11103 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Parp1P11103 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Parp1P11103 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Parp1P11103 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Parp1P11103 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Parp1P11103 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Parp1P11103 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Parp1P11103 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Parp1P11103 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Parp1P11103 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Parp1P11103 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Parp1P11103 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Parp1P11103 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Parp1P11103 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Parp1P11103 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Parp1P11103 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Parp1P11103 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Parp1P11103 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Parp1P11103 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Parp1P11103 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Parp1P11103 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Parp1P11103 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Parp1P11103 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Parp1P11103 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Parp1P11103 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Parp1P11103 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Parp1P11103 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Parp1P11103 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Parp1P11103 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Parp1P11103 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Parp1P11103 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Parp1P11103 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Parp1P11103 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Parp1P11103 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Parp1P11103 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Parp1P11103 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Parp1P11103 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms