Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P10404 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P10404 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P10404 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P10404 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P10404 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P10404 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
P10404 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P10404 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P10404 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P10404 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P10404 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P10404 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P10404 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P10404 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P10404 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P10404 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P10404 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P10404 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P10404 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P10404 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P10404 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P10404 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P10404 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P10404 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P10404 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P10404 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P10404 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P10404 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P10404 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P10404 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P10404 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P10404 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P10404 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P10404 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P10404 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P10404 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P10404 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P10404 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P10404 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P10404 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P10404 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P10404 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P10404 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P10404 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P10404 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P10404 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P10404 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P10404 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P10404 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P10404 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
P10404 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P10404 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P10404 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P10404 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P10404 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P10404 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P10404 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P10404 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
P10404 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
P10404 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P10404 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P10404 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P10404 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P10404 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P10404 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P10404 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P10404 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P10404 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P10404 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P10404 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P10404 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P10404 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P10404 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P10404 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P10404 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P10404 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P10404 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
P10404 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P10404 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P10404 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P10404 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P10404 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P10404 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P10404 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P10404 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P10404 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P10404 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P10404 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P10404 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P10404 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
P10404 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P10404 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P10404 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
P10404 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
P10404 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P10404 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P10404 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P10404 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P10404 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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