Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Zfp965-202ENSMUST00000109042 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Prl8a8-202ENSMUST00000110350 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Ccl20-202ENSMUST00000113437 794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Gm13924-201ENSMUST00000119899 486 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Gm15719-201ENSMUST00000120619 635 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Zfp973-202ENSMUST00000121956 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Gm22985-201ENSMUST00000122754 116 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Gm13499-201ENSMUST00000142804 603 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Gm23776-201ENSMUST00000158993 325 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Olfr772-201ENSMUST00000169800 1004 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Vmn1r-ps17-201ENSMUST00000175797 894 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Gm26671-201ENSMUST00000180423 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 C030010L15Rik-201ENSMUST00000181465 715 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Ccl20-203ENSMUST00000186832 772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Ociad2-206ENSMUST00000202012 876 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 AC153544.1-201ENSMUST00000217988 400 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Prl8a9-201ENSMUST00000006662 942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Olfr816-201ENSMUST00000071605 939 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Gm17063-201ENSMUST00000168135 456 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Vmn1r-ps143-201ENSMUST00000176730 604 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Gm43055-201ENSMUST00000198859 879 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 AC132237.2-201ENSMUST00000221702 1209 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 AC174797.4-201ENSMUST00000225510 347 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 AC133517.2-201ENSMUST00000226820 690 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Olfr1428-202ENSMUST00000208391 1368 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb4P10284 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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