Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms