Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms