Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Spta1P08032 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Spta1P08032 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Spta1P08032 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Spta1P08032 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Spta1P08032 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Spta1P08032 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Spta1P08032 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms