Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TtrP07309 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
TtrP07309 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
TtrP07309 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TtrP07309 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TtrP07309 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
TtrP07309 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TtrP07309 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TtrP07309 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TtrP07309 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TtrP07309 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TtrP07309 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TtrP07309 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TtrP07309 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TtrP07309 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
TtrP07309 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TtrP07309 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TtrP07309 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TtrP07309 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TtrP07309 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TtrP07309 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TtrP07309 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TtrP07309 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TtrP07309 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TtrP07309 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TtrP07309 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TtrP07309 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TtrP07309 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TtrP07309 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TtrP07309 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TtrP07309 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TtrP07309 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
TtrP07309 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TtrP07309 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TtrP07309 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
TtrP07309 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TtrP07309 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
TtrP07309 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TtrP07309 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TtrP07309 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TtrP07309 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TtrP07309 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TtrP07309 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
TtrP07309 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
TtrP07309 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
TtrP07309 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TtrP07309 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TtrP07309 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
TtrP07309 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TtrP07309 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
TtrP07309 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TtrP07309 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
TtrP07309 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
TtrP07309 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
TtrP07309 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TtrP07309 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
TtrP07309 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
TtrP07309 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
TtrP07309 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
TtrP07309 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
TtrP07309 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
TtrP07309 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TtrP07309 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
TtrP07309 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
TtrP07309 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
TtrP07309 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
TtrP07309 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
TtrP07309 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
TtrP07309 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
TtrP07309 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
TtrP07309 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TtrP07309 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
TtrP07309 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TtrP07309 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
TtrP07309 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TtrP07309 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TtrP07309 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
TtrP07309 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TtrP07309 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TtrP07309 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TtrP07309 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TtrP07309 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TtrP07309 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TtrP07309 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TtrP07309 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
TtrP07309 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TtrP07309 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TtrP07309 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TtrP07309 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TtrP07309 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TtrP07309 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
TtrP07309 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TtrP07309 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TtrP07309 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TtrP07309 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
TtrP07309 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
TtrP07309 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TtrP07309 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
TtrP07309 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TtrP07309 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms