Protein–RNA interactions for Protein: P06800

Ptprc, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, mousemouse

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Length 1,291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprcP06800 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprcP06800 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprcP06800 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprcP06800 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprcP06800 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprcP06800 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprcP06800 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PtprcP06800 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PtprcP06800 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtprcP06800 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtprcP06800 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtprcP06800 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtprcP06800 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtprcP06800 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtprcP06800 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtprcP06800 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtprcP06800 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtprcP06800 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtprcP06800 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtprcP06800 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtprcP06800 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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PtprcP06800 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtprcP06800 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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PtprcP06800 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtprcP06800 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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PtprcP06800 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PtprcP06800 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PtprcP06800 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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PtprcP06800 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtprcP06800 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtprcP06800 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtprcP06800 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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PtprcP06800 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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PtprcP06800 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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PtprcP06800 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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PtprcP06800 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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PtprcP06800 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtprcP06800 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtprcP06800 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtprcP06800 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtprcP06800 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtprcP06800 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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PtprcP06800 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtprcP06800 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtprcP06800 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtprcP06800 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtprcP06800 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtprcP06800 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtprcP06800 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtprcP06800 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtprcP06800 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtprcP06800 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtprcP06800 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtprcP06800 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtprcP06800 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtprcP06800 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtprcP06800 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtprcP06800 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
PtprcP06800 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms